中國科學院南京地理與湖泊研究所的前身系1940年8月在重慶北碚成立的中國地理研究所，是全國唯一以湖泊-流域系統為主要研究對象的綜合研究機構。中國科學院院士黃秉維、任美鍔、周立三曾先后擔任過所長。現有在職職工197人，其中有中科院院士1人、研究員35人、副研究員和高級工程師89人。在站博士后近20人，在學研究生規模超過150人。

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