研究所為研究生培養提供了良好的學習和科研環境。碩士研究生的學位課程教育在中國科技大學研究生院進行,博士研究生的學位課程教育由中國科學院研究生院上海教育基地承擔。學位論文的選題均結合導師承擔的科研和開發項目,能為學生開展創新性的論文研究工作提供良好的科研條件和技術支持。研究所日益廣泛的國際交流與合作也給學生提供了良好的科研機遇,越來越多的學生出國參加國際性學術會議,部分學生被選派到美國、日本等國家從事3-12個月的國際合作研究。圍繞上海光源的國際性交流合作即將全面啟動,其中包括研究生的聯合培養。目前正在與美國阿貢國家實驗室(Argonne National Laboratory)、瑞士保羅謝勒研究所(Paul Scherrer Institute)、澳大利亞墨爾本大學等研究制定相關培養計劃。