《生物信息學》考試大綱
一、基本要求
掌握生物信息學常用數據庫和使用方法;掌握序列比對方法和主要比對軟件使用方法;掌握DNA序列和蛋白質序列特征分析和常用序列分析軟件包使用方法;掌握分子進化理論和常用分析方法;掌握基因功能注釋方法和常用軟件使用方法;掌握基因表達數據分析方法和常用分析軟件使用方法。
二、考試范圍
1. 課程相關知識
基本要求:掌握生物信息學的定義、基本概念和發展;掌握生物信息學研究的基本內容、基本原理和生物學基礎;了解計算機在生物研究中的應用;了解生物信息學發展史、開發與產業化。
1.生物信息學數據庫
(1)知識點1:NCBI數據庫的介紹
(2)知識點2:Swiss-Prot數據庫
(3)知識點3:PDB數據庫
基本要求: 掌握NCBI數據庫的建設和使用方法;掌握Swiss-Prot和PDB數據庫的使用方法。
2.序列比對
(1)知識點1:雙重序列比對分析
(2)知識點2:多序列比對分析
(3)知識點3:BLAST數據庫搜索
基本要求:掌握序列比對的原理和方法;掌握如何使用BLAST軟件進行數據庫搜索和同源性分析。
3.序列特征分析
(1)知識點1:DNA序列特征分析
(2)知識點2:蛋白質序列特征分析
基本要求:掌握基因預測的原理和方法;掌握啟動子區域預測和分析的原理和方法;掌握蛋白質序列跨膜區分析的原理和方法。
4.分子進化分析
(1)知識點1:系統發育樹的概念
(2)知識點2:分子進化理論
(3)知識點3:系統發育樹的構建
基本要求:掌握系統發育樹的概念;掌握DNA和蛋白質序列適應性進化的分子理論;掌握系統發育樹構建的原理和方法。
5. 基因功能注釋
(1)知識點1:基因功能的基本概念
(2)知識點2:基因功能的注釋原理和方法
基本要求:掌握基因注釋和功能分類的基本概念;掌握基因功能注釋的原理和方法;掌握常用基因功能注釋軟件的使用;
6.基因表達數據分析
(1)知識點1:基因表達數據獲取的生物學技術平臺
(2)知識點2:基因表達數據分析
基本要求:掌握基因表達技術的主要生物學平臺;掌握基因表達數據的主要分析方法和原理;掌握基因表達數據分析常用軟件的使用。
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