有機化學專業是化學一級學科碩士學位授權點的主體和支撐專業之一。本碩士點現有教授2人。目前,本碩士點的研究領域有有機合成和天然產物分離與提取兩個方向。本碩士點先后主持國家自然基金、教育部重點課題、科技部“火炬計劃”、青海省重點科技攻關、青海省應用基礎和企業橫向合作等多項科研項目,在Food chemistry、Separation Science and Technology、Transaction of Chinese Society of Agricultural Engineering、《食品科學》、《天然產物研究與開發》等專業學術期刊發表論文60余篇,其中被SCI、EI收錄20余篇,申請國家發明專利3項。