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圖書簡介

生物信息學是一門新興的交叉學科。在該領域中，由生物學家和計算機科學家共同研究生物分子信息的獲取、管理、分析和利用。生物信息學以計算機、網絡為工具，用數學和信息科學的理論、方法和技術去研究生物大分子，研究生物分子信息組織的規律。本書緊緊圍繞基因組與后基因組研究，闡述生物信息學的方法、技術、資源及其核心算法，介紹各種信息學方法和技術在生物信息學中的應用。本書首先簡要說明生物信息學的研究對象及主要研究內容；然后介紹基本的序列比較算法，介紹各種生物信息學數據資源及主要數據庫；接下來以專題形式介紹基因組信息分析、分子系統發生分析及蛋白質結構預測；最后，介紹基因表達數據分析。為了便于計算機和數學研究人員進入生物信息學研究領域，本書還特別介紹了與生物信息學有關的基本分子生物學知識。
本書可以作為高年級大學生或研究生的生物信息學課程教材，也可以作為生命科學工作者、計算機應用人員的參考書。
目錄
第1章 生物信息學引論
　1.1 引言
　　1.1.1 生物信息學概念
　　1.1.2 生物分子信息
　　1.1.3 生物信息學的研究目標和任務
　　1.1.4 生物信息學的研究意義
　1.2 生物信息學的發展歷史
　1.3 人類基因組計劃和基因組信息學
　　1.3.1 人類基因組計劃簡介
　　1.3.2 人類基因組計劃對生物信息學的挑戰
　1.4 蛋白質結構與功能關系的研究
　1.5 生物信息學的主要研究內容
　　1.5.1 生物分子數據的收集與管理
　　1.5.2 數據庫搜索及序列比較
　　1.5.3 基因組序列分析
　　1.5.4 基因表達數據的分析與處理
　　1.5.5 蛋白質結構預測
　1.6 生物信息學所用的方法和技術
　　1.6.1 數學統計方法
　　1.6.2 動態規劃方法
　　1.6.3 機器學習與模式識別技術
　　1.6.4 數據庫技術及數據挖掘
　　1.6.5 人工神經網絡技術
　　1.6.6 專家系統
　　1.6.7 分子模型化技術
　　1.6.8 量子力學和分子力學計算
　　1.6.9 生物分子的計算機模擬
　　1.6.10 因特網（Internet）技術
　1.7 生物信息學目前的發展概況
　問題與練習
　參考文獻
第2章 生物信息學的生物學基礎
　2.1 細胞
　2.2 蛋白質的結構和功能
　　2.2.1 蛋白質的功能
　　2.2.2 蛋白質的分子組成
　　2.2.3 蛋白質的結構層次
　　2.2.4 蛋白質結構與功能的關系
　2.3 遺傳信息載體——DNA
　　2.3.1 核苷酸
　　2.3.2 DNA 的結構
　2.4 分子生物學中心法則
　　2.4.1 DNA的復制
　　2.4.2 轉錄
　　2.4.3 翻譯
　　2.4.4 mRNA的反轉錄與cDNA
　　2.4.5 對遺傳信息流的再認識
　2.5 基因組結構
　　2.5.1 染色體結構
　　2.5.2 基因
　　2.5.3 原核生物基因組
　　2.5.4 真核生物基因組
　2.6 基因表達調控
　　2.6.1 基因表達調控的層次
　　2.6.2 原核基因調控
　　2.6.3 真核基因調控
　2.7 新生肽鏈的折疊
　　2.7.1 新生肽鏈的加工
　　2.7.2 新生肽鏈的折疊
　　2.7.3 蛋白質折疊的一般規律
　　2.7.4 幫助新生肽鏈折疊的生物大分子
　　2.7.5 蛋白質構象病問題
　2.8 生物大分子結構的測定
　　2.8.1 X射線衍射結構分析
　　2.8.2 核磁共振結構分析
　2.9 分子生物學工具
　問題與練習
　參考文獻
第3章 序列比較
……
第4章 生物分子數據庫
第5章 基因組信息分析
第6章 系統發生分析
第7章 蛋白質結構預測
第8章 基因表達數據分析
附錄1 常用基本詞匯表
附錄2 生物信息分析工具GCG

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