社會兼職:擔任國家藥典委員會執行委員;中國藥學會理事、藥物化學專業委員會委員;江蘇省藥學會副秘書長、常務理事、藥物化學專業委員會主任委員;教育部實驗教學指導委員會委員;國際藥學聯合會規劃委員會委員,亞洲藥學院校理事會理事。此外還擔任《中國藥科大學學報》副主編,《藥學學報》、《中國藥物化學雜志》等13本雜志的編委等職務;擔任SCI雜志:Journal of Medcinal Chemistry, Chinese Chemical Letters的編委;擔任外文期刊:Chinese Journal of Pharmaceutical Sciences, Inter J Med Chem, Orphan Drugs: Research and Reviews等國際雜志的編委;擔任Journal of Medicinal Chemistry, PloS ONE, Current Medicinal Chemistry, European Journal of Medicinal Chemistry, Bioorganic Medicinal Chemistry, Bioorganic Medicinal Chemistry Letter等著名國際學術雜志特約審稿人。
尤啟冬教授先后獲教育部霍英東優秀青年教師獎、江蘇省“五一勞動獎章”、“禮來亞洲杰出研究生論文導師獎”、第十一屆吳階平--保羅-楊森獎;享受國家政府特殊津貼,被評為教育部高等學校優秀骨干教師、江蘇省有突出貢獻的中青年專家、“高等學校教學名師”等;獲省部級科技進步二等獎3項、三等獎3項,國家教學成果二等獎3項、江蘇省教學成果特等獎2項,獲得江蘇省優秀課程、教學成果獎多項。著有《藥物化學》、《Chiral Drugs: Chemistry and Biological Action》、《手性藥物》、《手性藥物研究與評價》等著作、教材20余本。